Indizierte Dateien

Ich habe ca. 20000 Dateien über indizieren nach Devonthink übertragen.
Wenn ich neue Dateien im Finder abgelegt habe, gehe ich auf synchronisieren, dann werden jedoch alle Dateien noch einmal übertragen. Wie kann ich das umgehen, bzw. besser regeln?
Wer kennt sich da aus?

Solange die Pfade bzw. Datei/Ordnernamen unverändert sind, sollten nur neue Ordner/Dateien hinzugefügt sowie geänderte Dateien synchronisiert werden. Auf was für einem Laufwerk befinden sich denn die Dateien?

Ich habe verschiedene Ordner auf meinem Schreibtisch abgelegt.

Befinden sich in diesen Ordnern Aliases?