Im Script-Menü gibt es ein Script “iCloud Drive indexieren”. Das scheint nicht zu funktionieren, jedenfalls tut sich bei mir rein gar nichts.
Das Skript indiziert nicht alles, sondern nur im Finder nach iCloud Drive kopierte/verschobene Objekte incl. dort vom Benutzer angelegter Ordner. App-spezifische Daten werden nicht indiziert.